中央办公厅直属高校只有一所，即北京电子科技学院。
北京电子科技学院是一所为全国各级党政机关培养密码保密和信息安全专门人才的普通高等学校，学院隶属于中共中央办公厅。
学院创建于1947年8月，前身为中央工委青年干部训练班。70多年来，先后经历了张家口军委工程学校、北京电子专科学校、北京电子科技学院等发展时期。2003年，学院与西安电子科技大学联合开展学术型硕士研究生教育。2011年，学院独立开展硕士专业学位研究生培养试点工作。2017年，学院获得硕士单位授予权。2018年，学院与中国科学技术大学、北京邮电大学联合开展博士研究生教育。学院位于北京市丰台区富丰路7号，现有全日制在校生2000余人。
学院始终牢记党的重托，全面贯彻党的教育方针，牢牢把握正确办学方向，秉持“忠诚、笃学、严谨、守纪”的校训，坚持政治立院、特色强院、人才兴院、依规治院，着力培养政治忠诚、学业扎实、作风严谨、纪律严明的合格人才，努力建设“专而特、专而精、专而优”的国内知名高校。经过70多年的建设，学院逐步发展成为一所以工为主，理、工、管协调发展的教学型普通高等学校。
学院现有4个系和2个教学部：密码科学与技术系、网络空间安全系、电子与通信工程系、密码保密管理系、思想政治理论教学研究部和人文社会科学教学研究部。下设8个本科专业：信息安全、密码科学与技术、电子信息工程、计算机科学与技术、通信工程、网络空间安全、保密管理和行政管理。学院现有硕士学位授权点2个：网络空间安全、电子信息（包括电子与通信工程领域、计算机技术领域），与西安电子科技大学联合培养信息与通信工程、计算机科学与技术硕士研究生；与中国科学技术大学、北京邮电大学联合培养网络空间安全博士研究生。